Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LRRTM2O43300 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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