Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 BOLA2P1-201ENST00000584794 232 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AP001120.4-201ENST00000590231 108 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC015802.4-202ENST00000591967 474 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC008758.2-201ENST00000420038 695 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL158070.1-201ENST00000421614 631 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 OR10J9P-201ENST00000511932 987 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 ORMDL2-203ENST00000548974 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 PCAT29-202ENST00000558941 545 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC007785.3-202ENST00000601033 518 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 FAM27E3-202ENST00000614611 340 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 PRPS1L1-202ENST00000638645 957 ntAPPRIS P2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
BBS9Q3SYG4 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
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