Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC005355.2-201ENST00000625064 484 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AL161742.1-201ENST00000418154 584 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC004839.1-201ENST00000610269 501 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP6Q3SY56 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms