Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RNU2-45P-201ENST00000516068 187 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AC022001.1-201ENST00000605193 268 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PDK4Q16654 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.2 ms