Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TAF1AQ15573 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms