Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SP140Q13342 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC005277.2-201ENST00000617898 390 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SP140Q13342 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 MRPS33-202ENST00000393008 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SP140Q13342 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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