Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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