Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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