Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
XCL2Q9UBD3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms