Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL42Q9P2K6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms