Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SCAF1Q9H7N4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF1Q9H7N4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms