Protein–RNA interactions for Protein: Q96L73

NSD1, Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-36 and H4 lysine-20 specific, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD1Q96L73 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NSD1Q96L73 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms