Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SLC41A2Q96JW4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms