Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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LINC00269Q8N2A0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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LINC00269Q8N2A0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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LINC00269Q8N2A0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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LINC00269Q8N2A0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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LINC00269Q8N2A0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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LINC00269Q8N2A0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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LINC00269Q8N2A0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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LINC00269Q8N2A0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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LINC00269Q8N2A0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00269Q8N2A0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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