Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HERC6Q8IVU3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HERC6Q8IVU3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms