Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP1Q7L576 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP1Q7L576 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP1Q7L576 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP1Q7L576 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP1Q7L576 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP1Q7L576 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP1Q7L576 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP1Q7L576 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP1Q7L576 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP1Q7L576 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP1Q7L576 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP1Q7L576 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP1Q7L576 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP1Q7L576 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP1Q7L576 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP1Q7L576 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP1Q7L576 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CYFIP1Q7L576 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CYFIP1Q7L576 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CYFIP1Q7L576 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYFIP1Q7L576 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms