Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
HECW1Q76N89 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HECW1Q76N89 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms