Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf139Q6ZV77 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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C9orf139Q6ZV77 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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C9orf139Q6ZV77 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf139Q6ZV77 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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