Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP188Q5SRE5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP188Q5SRE5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms