Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC27A3Q5K4L6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC27A3Q5K4L6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms