Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSPNQ14714 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SSPNQ14714 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms