Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DDX39BQ13838 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDX39BQ13838 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
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