Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FHL3Q13643 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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