Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHC1P29353 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHC1P29353 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHC1P29353 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHC1P29353 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHC1P29353 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHC1P29353 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHC1P29353 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHC1P29353 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHC1P29353 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHC1P29353 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHC1P29353 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHC1P29353 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHC1P29353 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHC1P29353 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHC1P29353 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHC1P29353 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SHC1P29353 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHC1P29353 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHC1P29353 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHC1P29353 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHC1P29353 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHC1P29353 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHC1P29353 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHC1P29353 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHC1P29353 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHC1P29353 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHC1P29353 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHC1P29353 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHC1P29353 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHC1P29353 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHC1P29353 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHC1P29353 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHC1P29353 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SHC1P29353 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHC1P29353 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHC1P29353 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHC1P29353 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHC1P29353 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHC1P29353 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHC1P29353 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHC1P29353 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SHC1P29353 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SHC1P29353 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHC1P29353 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHC1P29353 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHC1P29353 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHC1P29353 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHC1P29353 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHC1P29353 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHC1P29353 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SHC1P29353 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms