Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB2P29033 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB2P29033 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB2P29033 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB2P29033 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB2P29033 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB2P29033 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB2P29033 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB2P29033 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB2P29033 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB2P29033 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB2P29033 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB2P29033 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB2P29033 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB2P29033 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB2P29033 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB2P29033 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB2P29033 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB2P29033 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB2P29033 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB2P29033 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB2P29033 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB2P29033 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB2P29033 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB2P29033 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB2P29033 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB2P29033 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB2P29033 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB2P29033 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB2P29033 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms