Protein–RNA interactions for Protein: P28062

PSMB8, Proteasome subunit beta type-8, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB8P28062 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMB8P28062 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMB8P28062 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms