Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MARK3P27448 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK3P27448 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK3P27448 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK3P27448 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK3P27448 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK3P27448 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK3P27448 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK3P27448 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK3P27448 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK3P27448 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK3P27448 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK3P27448 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK3P27448 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK3P27448 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK3P27448 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK3P27448 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK3P27448 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK3P27448 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK3P27448 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK3P27448 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARK3P27448 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MARK3P27448 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MARK3P27448 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MARK3P27448 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MARK3P27448 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MARK3P27448 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms