Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAPN2P17655 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms