Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYL1P12980 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYL1P12980 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYL1P12980 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYL1P12980 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYL1P12980 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYL1P12980 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYL1P12980 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYL1P12980 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYL1P12980 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYL1P12980 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYL1P12980 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYL1P12980 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYL1P12980 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYL1P12980 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYL1P12980 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYL1P12980 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYL1P12980 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LYL1P12980 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LYL1P12980 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LYL1P12980 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LYL1P12980 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LYL1P12980 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms