Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD28P10747 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD28P10747 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD28P10747 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD28P10747 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD28P10747 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD28P10747 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD28P10747 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD28P10747 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD28P10747 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD28P10747 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD28P10747 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD28P10747 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD28P10747 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD28P10747 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD28P10747 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD28P10747 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD28P10747 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD28P10747 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD28P10747 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD28P10747 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD28P10747 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD28P10747 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD28P10747 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD28P10747 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD28P10747 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD28P10747 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD28P10747 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms