Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CT47B1P0C2W7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CT47B1P0C2W7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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