Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNTO95613 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNTO95613 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNTO95613 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNTO95613 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNTO95613 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNTO95613 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNTO95613 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNTO95613 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNTO95613 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNTO95613 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNTO95613 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNTO95613 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCNTO95613 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNTO95613 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNTO95613 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNTO95613 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNTO95613 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNTO95613 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNTO95613 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNTO95613 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNTO95613 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNTO95613 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNTO95613 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNTO95613 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNTO95613 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNTO95613 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNTO95613 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNTO95613 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCNTO95613 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCNTO95613 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCNTO95613 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCNTO95613 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCNTO95613 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCNTO95613 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCNTO95613 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCNTO95613 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCNTO95613 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCNTO95613 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCNTO95613 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNTO95613 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNTO95613 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNTO95613 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNTO95613 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNTO95613 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNTO95613 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNTO95613 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNTO95613 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNTO95613 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNTO95613 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNTO95613 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNTO95613 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNTO95613 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNTO95613 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNTO95613 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNTO95613 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNTO95613 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNTO95613 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNTO95613 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCNTO95613 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNTO95613 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNTO95613 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNTO95613 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNTO95613 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNTO95613 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNTO95613 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNTO95613 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNTO95613 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNTO95613 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNTO95613 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNTO95613 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNTO95613 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNTO95613 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNTO95613 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCNTO95613 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCNTO95613 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCNTO95613 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCNTO95613 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCNTO95613 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms