Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTPRTO14522 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRTO14522 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
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