Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CROCC2H7BZ55 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CROCC2H7BZ55 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms