Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP17L13C9JLJ4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L13C9JLJ4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms