Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC169A6NNP5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC169A6NNP5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms