Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
USP18Q9UMW8 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms