Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC134698.1-201ENST00000511619 643 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.8 ms