Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 LRRC37A6P-202ENST00000448648 5444 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 ITSN2-202ENST00000361999 5814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 RIPOR2-206ENST00000538035 5389 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 SVEP1-202ENST00000374469 12194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 ERC1-202ENST00000355446 5796 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 PRICKLE2-AS1-201ENST00000482609 6505 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 LINC00483-203ENST00000450727 686 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AC008655.2-201ENST00000597049 304 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
LRRIQ1Q96JM4 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 PTPRT-207ENST00000373201 12660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 RAD18-201ENST00000264926 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LRRIQ1Q96JM4 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms