Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
FAM187BQ17R55 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms