Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 OSTCP2-201ENST00000437956 444 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 CT45A3-202ENST00000598716 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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BRD3Q15059 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 HESX1-201ENST00000295934 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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BRD3Q15059 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 BX005266.3-201ENST00000443013 1075 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC134698.1-201ENST00000511619 643 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
BRD3Q15059 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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