Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NWD1Q149M9 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NWD1Q149M9 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NWD1Q149M9 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NWD1Q149M9 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NWD1Q149M9 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
NWD1Q149M9 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
NWD1Q149M9 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 SVEP1-202ENST00000374469 12194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 SVIL-202ENST00000375398 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
NWD1Q149M9 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.6 ms