Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
RFTN1Q14699 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms