Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 GSTCD-201ENST00000360505 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
CACNA1SQ13698 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 SCUBE3-201ENST00000274938 7356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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