Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ITGB3BPQ13352 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms