Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SRSF5Q13243 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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