Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
EPHB4P54760 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms