Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL355306.2-201ENST00000635570 1542 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 CU633906.1-201ENST00000621924 2380 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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HOXD10P28358 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD10P28358 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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