Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 ASAH1-203ENST00000381733 2512 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 TEFM-204ENST00000580840 2109 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 FO393409.1-201ENST00000399325 1372 ntBASIC8□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 HNRNPC-211ENST00000554455 1784 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 AC006213.1-202ENST00000589021 2176 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
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PTPRAP18433 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
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PTPRAP18433 AC026464.2-201ENST00000567834 2421 ntBASIC8□□□□□ -1.13
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PTPRAP18433 CACNA1D-219ENST00000636938 6868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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PTPRAP18433 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPRAP18433 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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