Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD10-204ENST00000361815 768 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1E9PL57 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018765.1-201ENST00000623357 3446 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162456.1-201ENST00000634535 2006 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NEDD8-MDP1E9PL57 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms